在上海注册公司的企业所交纳的增值税25%归上海市所有。上海增值税的分成由市政府、区政府、开发区、企业等几个方面分别分享增值税的分成。 1、市政府增值税分成 上海除崇明岛之外，每个区的公司所交纳的增值税，市政府拿走整个上海市所留增值税的40%。 2、区政府增值税分成 区政府一般分走本区企业所交纳增值税上海市留存部分的20-40%。 3、开发区增值税分成 在郊区开发区注册的公司，有增值税分成的权力，开发区一般能分到上海市留存部分10-20%的增值税。 4、企业增值税分成 企业增值税分成，即我们通常所说的返税优惠政策。在上海，只有注册在开发区里的企业才可以享受增值税返税优惠政策。上海各郊区开发区返给企业的增值税是有很大差异的，一般返给企业在4-9%之间。 在上海市区注册的公司，以前可以由街道办事处给予企业返税，但自2009年开始，上海市取消了市区街道办事处的返税功能。