不过，若仍制定一个预拨门槛，貌似仍会存在前述中小企业对补贴不公平的担忧。毕马威华南区税务合伙人李雁指出，各地财政补贴标准主要依据当地财政承担能力而定，要求全国有统一的标准不大可能。通常而言，各地会依据“重要性原则”，只有当营改增影响的税负确实增加，对企业经营产生影响时进行财政扶持，这也是政府实现改革目标的一个对策。

　　胡怡建进一步指出，财政补贴只是一个过渡政策，不是长久之计。因为交通运输部分企业税负增加的情况，在未来即便营改增全面推开后，可能这部分企业的税负仍不能有效减轻。未来只有通过增加交通运输企业的抵扣项目，如纳入过桥过路费等，才能切实减轻企业税负。

　　不过，李雁认为，部分交通运输企业税负增加可能也只是暂时的，这些企业由于在试点前购进了设备，导致抵扣项少；但未来这些运输企业会就设备进行维修，或者更换，这就能为企业带来大量进项。

　　中国社会科学院财经战略研究院研究员张斌，曾对营改增部分试点企业进行调研。张斌指出，部分企业税负增加，可能是企业在缴纳营业税时，存在偷漏税现象。因为若比较企业营业税应缴纳税额，和改为增值税后应缴纳增值税，若企业进行营改增，是减税的。之所以出现税负增加的问题，在于增值税在征管和缴纳环节，要比营业税规范得多，按增值税缴税，企业逃避税款的空间减少了。