应当按照财产转让所得计征个人所得税。公司清算主要用三个步骤：资产处置、按顺序偿债、剩余财产分配。

　　个人投资者取得的清算分配=（目标公司股本+目标公司留存收益）×股权比例。其中：

　　目标公司留存收益=经营期累计留存收益+（清算损益-清算所得税）

　　应纳税额=（个人投资者取得的清算分配-投资成本）×20%。其中：

　　投资成本=初始投资成本+追加投资成本（含目标公司用留存收益、除资本溢价外的资本公积转增个人股本的金额）

　　需要注意的是，投资成本与目标公司股本可能不同，投资成本是指为取得该项股权支付的全部对价，对于个人通过增资扩股、收购股权等方式取得的股权，投资成本往往高于目标公司个人股本。