根据外省市税务机关协查提供11份发票的案情资料，上海市某税务稽查局对上海E装饰工程公司进行了专案检查。

　　经查，上海E装饰工程公司开具给“南京某房地产开发有限公司”11份发票，除发票抬头和发票号码外，其他票面填写信息均不相符，属于阴阳发票。在协查同时，发现上海E装饰工程公司开具给“某置业有限公司”6份发票，也为阴阳发票，其“发票联”金额与“存根联”金额严重不符。

　　税务机关根据《中华人民共和国增值税暂行条例》、《中华人民共和国企业所得税法》、《中华人民共和国税收征收管理法》等法律、法规规定，追缴税款及附加费用、加收滞纳金、处罚款共计99.82万元；并对上海E装饰工程公司未按规定设置账簿、编制记账凭证等行为，责令在一个月内健全财务核算制度、规范核算，处1,000元罚款。