行企业所得税的年度汇算清缴，统一计算企业的年度应纳所得税额，抵减总机构、分支机构当年已就地分期预缴的企业所得税款后，多退少补税款。这样，就为分支机构合理节税提供了政策依据和保障。
    当企业设立分支机构时，由于设立初期分支机构面临高昂的成本支出，亏损的概率较高，通常采用分公司的形式较合适，可享受和总部收益盈亏互抵的好处。经过两三年的经营期间，分公司开始转亏为盈，再把分公司变更注册为子公司，可以降低分支机构对总机构的法律影响。
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    八类分支机构不需就地预缴所得税
    根据财政部、国家税务总局、中国人民银行关于印发《跨省市总分机构企业所得税分配及预算管理暂行办法》的通知等相关文件规定，以下八类分支机构不需就地预缴企业所得税，这为总部和分公司汇总纳税提供了更优越的条件，可以更好地享受总分机构汇总纳税政策，避免了因分公司就地预缴企业所得税而造成货币时间价值的损失：
    ●垂直管理的中央类企业，其分支机构不需要就地预缴企业所得税。
    ●三级及以下分支机构不就地预缴企业所得税，其经营收入、职工工资和资产总额统一计入二级分支机构。
    ●分支机构不具有独立生产经营的职能部门时，该不具有独立生产经营的职能部门不就地预缴企业所得税。
    ●不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等企业内部辅助性的二级及以下分支机构，不就地预缴企业所得税。
    ●上年度认定为小型微利企业的，其分支机构不就地预缴企业所得税。
    ●新设立的分支机构，设立当年不就地预缴企业所得税。
    ●撤销的分支机构，撤销当年剩余期限内应分摊的企业所得税款由总机构缴入中央国库。
    ●企业在中国境外设立的不具有法人资格的营业机构，不就地预缴企业所得税。