编制财务报表和账簿，并与总部微机联网、实行统一规范管理的企业，其企业所得税由总部统一缴纳，跨区域机构不就地缴纳企业所得税。凡不符合上述条件之一的跨区域机构，不得纳入统一纳税范围，应就地缴纳企业所得税。
    三、房产税
    根据《中华人民共和国房产税暂行条例》规定，物流企业适用的房产税包括两类：一是就其拥有的房产按房产原值一次减除10%-30%（江苏减除30%）的余值后按1.2%税率计征房产税；二是按房产出租的租金收入计征，应就其取得的租金按12%的比率征收房产税。
    四、印花税
    对于印花税，《中华人民共和国印花税暂行条例》规定，印花税是一种具有行为税性质的凭证税，凡发生书立、使用、领受应税凭证的行为，就必须依照印花税法的有关规定履行纳税义务。就物流企业而言，与客户签订的财产租赁合同、货物运输合同、仓储保管合同就合同金额的一定比率缴纳印花税。
    五、货运企业开票“警戒线”
    为进一步贯彻总局关于整顿市场经济秩序的决定，加强对货物运输业的税收征管，堵塞税收征管漏洞，各地结合其货物运输市场实际，对公路、水路货物运输行业税收管理设置营运收入开票金额“警戒线”，对货物运输营运收入在“警戒线”标准以下的，为正常范畴，税务机关按正常程序供票（开票）征税。同时，严格对新办货运企业自开票纳税人资格的认定，明确税收管理员跟踪管理，实行以票控税、严格发票验旧购新制度、货运代开票管理、专项纳税评估等方面加强管理。
    常见问题解答
    1、问一：我公司是一家物流企业，2011年10月发生一项运输货物的业务，收取运费总额20000元，但是在运输途中发生货物毁损500元，损失由我公司承担，毁损的货物也直接交由我公司处置。请问：我公司可否将货物毁损的500元从收取的运费总额20000元中扣除，按19500元交营业税？
    答：根据《中华人民共和国营业税暂行条例》规定：纳税人的营业额为纳税人提供应税劳务、转让无形资产或销售不动产收取的全部价款和价外费用。你单位应按全额20000元确定计税营业额，承担的500元损失不能从营业额中扣除。
    2、问二：我公司是一家物流公司，从事运输与货代业务，请问应如何纳税？
    答：根据《中华人民共和国营业税暂行条例》规定，物流企业提供运输、配送、装卸、搬运等劳务取得的收入，按“交通运输业”缴纳营业税，税率为3%；物流企业提供货代、仓储、包装、物流加工、租赁等业务按“服务业”税目征税，税率为5%。你公司应对这两种业务分别核算，提供运输劳务取得的运输收入按“交通运输业”税目征收营业税并具货物运输业发票。提供货代劳务取得的收入按“服务业”税目征收营业税并具服务业发票。凡未按规定分别核算其营业税应税收入的，一律按“服务业”税目征收营业税。